Αν και είναι ξεκάθαρο ότι ο Cruise έχει μια εξαιρετική σχέση με την Isabela και τον Conor είναι λιγότερο σαφές τι είδους σχέση, αν υπάρχει, έχει με τη Suri.
Ο Κρουζ είναι πατέρας τριών παιδιών. Μοιράζεται τα μεγαλύτερα του, την Isabella και τον Conor, με την πρώην σύζυγό του Nicole Kidman και τη μικρότερη, Suri, με την πρώην σύζυγό του Katie Holmes.
Αν και είναι ξεκάθαρο ότι ο Cruise έχει μια εξαιρετική σχέση με την Isabela και τον Conor και και τα δύο παιδιά είναι ενεργά μέλη της πίστης του στη Σαηεντολογία (σύμφωνα με το The U.S. Sun), είναι λιγότερο σαφές τι είδους σχέση, αν υπάρχει, έχει με τη Suri.
Στην πραγματικότητα, όταν η Holmes και ο Cruise χώρισαν, επιβεβαίωσε ότι η επιθυμία της Holmes να κρατήσει τη Suri μακριά από την πίστη της Σαηεντολογίας ήταν ένας παράγοντας στο διαζύγιό τους.
Οι τελευταίες δημόσιες φωτογραφίες του Cruise και της Suri χρονολογούνται από το 2012, όταν οι δυο τους βρέθηκαν στην Disneyland.
Όπως πολλοί μελλοντικοί γονείς, ο Tom Cruise ήταν εκστασιασμένος με τον επικείμενο ερχομό του τρίτου παιδιού του! Μάλιστα, ήταν τόσο ενθουσιασμένος με τη Suri που φέρεται να αγόρασε το δικό του μηχάνημα υπερήχων για να μπορεί να τη βλέπει καθημερινά! Μόνο λίγες μέρες μετά τη γέννησή της, ο Cruise περιέγραψε την εμπειρία της γέννησης της κορης του στο «20/20» και είπε, "Ήταν όλα όσα θέλαμε να είναι... Ήταν πνευματικό. Ήταν ισχυρό. Ήταν απερίγραπτο."
Τα πράγματα έγιναν πιο μπερδεμένα για τον Cruise το έτος μετά την οριστικοποίηση του διαζυγίου του. Το 2013, παραδέχτηκε ότι δεν είχε δει το μικρότερο παιδί του για τουλάχιστον 100 ημέρες, εξηγώντας ότι η παρατεταμένη απουσία του οφειλόταν στο πρόγραμμα των γυρισμάτων του.
Σύμφωνα με το People, ο Cruise είπε σε μια ακρόαση κατάθεσης ότι ήταν "αδύνατο" γι' αυτόν να δει τη Suri εκείνη την περίοδο, και επιπλέον, ισχυρίστηκε ότι η τότε 7χρονη φαινόταν μια χαρά χωρίς αυτόν. Αφού μοιράστηκε ότι είναι «πολύ καλός» στο να μιλάει με την κόρη του στο τηλέφωνο, ο Cruise πρόσθεσε: «Βρίσκω επίσης ότι, ξέρετε, η Suri είναι ένα πολύ χαρούμενο παιδί, με αυτοπεποίθηση και έχει καλή αίσθηση του εαυτού της».
Εξήγησε περαιτέρω ότι, αν και έχασε την πρώτη μέρα του σχολείου της Suri, αυτό ήταν επειδή η κόρη του δεν του ζήτησε να είναι η ίδια εκεί.
Ενώ ο Cruise μπορεί να ήταν σε θέση να εξηγήσει γιατί δεν είδε τη Suri για 100 ημέρες, στη συνέχεια φέρεται να έχασε την ευκαιρία να δει την κόρη του προσωπικά για περισσότερες από 1.000 ημέρες! Το 2016 δε, το In Touch Weekly ανέφερε ότι ο Cruise δεν είχε δει ούτε ανταλλάξει λόγια με τη Suri εδώ και δυόμισι χρόνια. Μια πηγή που φέρεται κοντά στην κατάσταση είπε στο δημοσίευμα ότι το ζευγάρι χρησιμοποιούσε συνομιλία μέσω βίντεο και μηνύματα κειμένου για να μείνει σε επαφή, αλλά ότι είχε κάπως χαθεί, προτού προσθέσει ότι η Suri δεν πίστευε πλέον πραγματικά τις εξηγήσεις του πατέρα της για το λόγο που έλειπε. Η πηγή είπε, «Χρησιμοποιεί τις κινηματογραφικές του δεσμεύσεις ως δικαιολογία, αλλά η αλήθεια είναι ότι δεν έχει σχέση πια με τη Suri».
Όπως και στο παρελθόν, ορισμένοι πιστεύουν ότι η θρησκεία του Cruise είναι ο λόγος που συνεχίζει να χάνει τη ζωή της κόρης του. Η ίδια πηγή είπε το ίδιο στο In Touch, σημειώνοντας: "Έχει αποσυνδεθεί από την Katie και μετά από τη Suri, λόγω της σύνδεσής της με την Katie. Δεν την έχει δει από τότε που ήταν 7 ετών!"
Παρά την φερόμενη παρατεταμένη περίοδο αποξένωσης του από τη Suri, ένας υποτιθέμενος φίλος του δήλωσε ότι ο ηθοποιός δεν ήθελε ποτέ να είναι τόσο μακριά από την κόρη του.
Αν και δεν είναι σαφές πότε ο Cruise θα επανασυνδεθεί ποτέ με την κόρη του, αν υποθέσουμε ότι οι αναφορές για την αποξένωσή τους είναι αληθινές, ένα πράγμα που σίγουρα ισχύει είναι ότι η διαδρομή για να φτάσουμε σε αυτό το σημείο ήταν μακρά, ελικοειδής και, να πω την αλήθεια, αρκετά μπερδεμένη. Ίσως οι δυο τους να έρθουν πιο κοντά όταν η Suri είναι ενήλικη.